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项目定义
空间代谢组是基于质谱成像技术发展而来的，免标记、无需基质、周期短。通过质谱成像技术对不同组织器官中的代谢物进行定性、定量、定位三个维度的分析，突破传统代谢组研究损失空间信息的瓶颈。空间代谢组学作为一种新型的分子影像技术，能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源性药物等分子的结构、含量和空间分布信息。
空间代谢组学作为一种新型的分子影像技术能够直接从生物组织中获得大量已知或未知的内源性代谢物和外源性药物等分子的结构、含量和空间分布信息。相对于其他成像方法（如荧光成像、放射性标记成像等），该技术无需化学或放射性标记、不需复杂样品前处理，具有高特异性、高通量和空间信息保留的突出优势。质谱成像技术可以实现生物组织中上千代谢物的定性、定量和定位分析，结合生物信息学分析，发展为空间代谢组学方法，可从生物组织原位发现差异代谢物，并识别其生物学功能。
技术流程
从样本接受到空间代谢组学的标志物筛选
（1） 在电喷雾毛细管喷嘴上施加一定高电压，喷雾溶剂从雾化器的内套管中流出，由外套管中喷出的高压氮气迅速将喷雾溶剂雾化形成带电喷雾液滴；
（2） 喷出的高速带电液滴轰击待测样品表面，在溶剂萃取作用下样品同时被解吸与电离；
（3） 含有被测样品的带电液滴迅速发生去溶剂化作用，从质谱分析器的采集锥孔进入分析器并被检测；
（4）样品固定在承载平台，连续或脉冲移动承载平台对样品进行二维扫描；
（5）同时质谱仪记录质谱信号强度获得样品表面的分子及其含量；
（6）这些信息通过质谱图像分析软件转换后，即可获得选择离子或离子群的二维空间强度分布图
常见质谱成像技术区别
类型 | AFDESI-MSI | EDSI-MSI | MALDI-MSI |
样本类型 | 新鲜组织 | 新鲜组织 | 新鲜组织 |
可检测样本大小 | 5mm*5mm~2cm*4cm；可测量整只小鼠/大鼠的切片 | 大至7.5cm~2.5cm（一张载玻片） | 大至7.5cm~2.5cm（一张载玻片） |
检测物质类型 | 1000Da以下的小分子代谢物：胆碱类、多氨类、氨基酸类、肉碱类、核苷类、核苷酸类、有机酸类、碳水化合物类、胆固醇类、胆酸类、脂质类等多种类代谢物 | 1000Da以下代谢物，偏向脂质 | 蛋白、多肽、脂质 |
空间分辨率 | 100um*100um、20um*20um | 50um | 5-50um |
质量分辨率 | 根据链接的质谱仪 | 根据链接的质谱仪 | 根据链接的质谱仪 |
是否需要基质 | 否 | 否 | 是 |
基质影响 | 无 | 无 | 对小分子代谢物检测的抑制较严重 |
应用方向
样本类型
未经过福尔马林浸泡、HE染色，荧光标记等处理的新鲜组织样本；
小至直径2mm*2mm，大至整只大鼠、小鼠（15cm×10cm）。常规样本大小为1cm3左右；
送样准备
（1）实验前准备
预冷生理盐水50mL离心管中，封口膜或保鲜膜、锡箔纸、干冰、液氮、滤纸片、镊子、记号笔等；
（2）样本处理流程
（3）送样流程
干冰寄送时，将样本盒埋没于干冰中，保证其上下都有干冰覆盖；干冰的量根据每天4公斤来计算，使用厚实（2cm以上厚度）的泡沫箱寄送。
（4）送样注意事项
在允许的条件下，建议多准备一份样品作为备用；
样本质量是影响实验结果的最关键因素，因此在采集、制备、贮存、运输过程中应尽可能地做到迅速，最大限度的缩短样本从采集到实验的时间。
空间代谢组一般建议多少生物学重复？
对于个体差异比较小的样本类型生物学重复建议每组至少3重复；
对于群居性较大型动物（牛、羊、猪等），建议5重复；
对于临床样本，个体差异非常大，建议每组≥5重复；
组织需要灌流处理吗？
建议不进行灌流，灌流液有可能带走一些水溶性的代谢物，灌流力度不合适，也会造成组织结构的改变。但若不考虑水溶性代谢物或者想要排除血液中代谢物，那么可以考虑灌流。
如何选择合适的切面？
切面取决于客户的研究目的，切片需要涵盖研究关注的区域，特别是像脑组织等具有复杂结构的组织或有特殊要求的。建议客户到公司共同完成切片的过程，提高切片的成功率，也减少中间沟通的时间成本；像肿瘤组织，最好能包含癌、癌旁和癌远端组织，一般选择最大截面进行切片。
