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在3D定量技术中，主要根据保留时间（Retention time）、质荷比（m/z）和强度（Intensity）三个维度的性质对肽段进行定性和定量。离子淌度（Ion Mobility）概念的引入使蛋白质组学进入了4D新时代，在m/z维度上无法分离的离子可以根据离子淌度得以分离。4D蛋白质组学基于timsTOF Pro质谱平台，将数据依赖性采集（DDA）、数据非依赖性采集（DIA）或平行反应监测（PRM）与同步累积连续碎裂（PASEF）技术相结合。第四维度的离子淌度依据离子大小和形状，或者更准确地说是离子的碰撞截面积（Collisional cross section，CCS）来实现对离子的分离，实现准确高效的4D定量蛋白质组学。4D-蛋白质组学以更少上样量，实现高速度、高灵敏度、高通量、高覆盖度的蛋白质组学检测，并在基础研究、转化医学、临床蛋白质组学等各个方面展现出了广阔的发展前景和强大的生命力。
仪器平台：
Bruker-tims TOF Pro质谱平台
实验流程图：
应用领域：
| 4D | 产品类型 | 采集模式 | 应用方向 |
| 4D-label free | DDA+PASEF | 适于各类样本，尤其是微量样品：细胞、血液、石蜡切片等 | |
| 4D-DIA | DIA+PASEF | 适于大规模样本研究：临床大对列样本等 | |
| 4D-PRM | PRM+PASEF | 非靶蛋白组学数据可靠性验证，biomarker或功能验证 |
部分结果展示：
个性化分析主要结果展示
样品类型 | 4D--蛋白质组学 |
动物组织 | >50mg |
植物组织 | >200mg |
细胞样品 | >1x107 |
血液、脑脊液等体液 | >100μl |
微生物类(菌类) | >50mg |
1、什么是4D定量蛋白组学测试？
4D定量蛋白组学测试是一种基于质谱的蛋白质组学技术，它在传统的3D分析（保留时间、质荷比、离子强度）基础上引入了第四个维度——肽段的碰撞截面积（CCS）或离子淌度。这一额外的维度可以显著提高质谱的扫描速度和检测灵敏度，使蛋白质组学分析更加全面和精确。
2、4D定量蛋白组学测试与传统蛋白组学测试相比有什么优势？
与传统的3D蛋白组学测试相比，4D定量蛋白组学测试具有显著的优势。首先，它可以大幅度提高质谱扫描速度和检测灵敏度，实现蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的革命性提升。其次，4D技术可以无遗漏地获得样本中所有离子的全部碎片信息，从而在定量上获得更多定量信息，且基于MS2信号，定量准确度更高，重复性更好。
3、4D定量蛋白组学测试的准确性如何？
4D定量蛋白组学测试具有极高的准确性。由于它引入了肽段的碰撞截面积（CCS）或离子淌度这一额外的维度，可以在离子累积的同时根据离子淌度分批释放离子，从而显著提高数据采集速度、检测灵敏度和分辨率。此外，4D技术采用的数据非依赖采集模式（DIA）可以对样本的所有离子信息进行循环检测，减少缺失值，使检测更全面，更适合进行大规模的研究。
4、4D定量蛋白组学测试需要什么样的样品？
4D定量蛋白组学测试需要高质量的生物样品。样品的制备方法、处理过程以及保存条件等都会对测试结果产生影响。因此，在进行4D定量蛋白组学测试之前，需要仔细考虑样品的制备和处理方法，以确保样品的质量和稳定性。
5、4D定量蛋白组学测试在哪些领域有应用前景？
4D定量蛋白组学测试在多个领域都有广泛的应用前景。例如，在生物医学研究中，它可以用于研究疾病的发生和发展机制、药物靶点的发现和验证等方面。此外，在农业、环境科学等领域，4D定量蛋白组学测试也可以用于研究生物体的代谢过程、蛋白质互作等方面
