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荧光显微镜是以紫外线为光源， 用以照射被检物体， 使之发出荧光， 然后在显微镜下观察物体的形状及其所在位置。用于研究细胞内物质的吸收、运输、化学物质的分布及定位等。 细胞中有些物质，如叶绿素等，受紫外线照射后可发荧光；另一些物质本身虽不能发荧光，但如果用荧光染料或荧光抗体染色后，经紫外线照射亦可发荧光，荧光显微镜就是对这类物质进行定性研究的工具之一。
1、菌液/污泥/污水类样品
① 样品量：5000 rpm离心10 min，可得到绿豆大小沉淀，参考图（1.5 mL离心管）大小的菌体沉淀
②细菌类需要死活染色/ROS染色的，一般加冰袋泡沫盒4度保存，样品不和冰袋接触。
③蛋白/多糖类染色，一般加冰袋泡沫盒4度保存或者2.5%的戊二醛固定4度保存，样品不和冰袋接触。
④污泥类样品可以进行冰切或者刀切，冰切收费50/样。
2、生物膜样品
①样品量：金属/瓷砖/岩石等块体类建议长宽高尺寸不超过1 cm，薄膜类直径尺寸不超过2 cm；且均要求样品表面平整，需要标出拍摄面。
②一般加冰袋泡沫盒4度保存，样品不和冰袋接触
③若在爬片上培养生物膜，可将爬片粘于培养皿底部，充满培养基，封口膜密封完全，再4度保存。
3、植物类
①植物类样品可进行简单冰切及刀切，软化等特殊类请走病理组织切片测试项目
②一般加冰袋泡沫盒4度保存，样品不和冰袋接触
③做过的植物类样品淀粉、胡萝卜，土豆、叶片、根、茎，拟南芥等。
4、需要与细胞共培养的样品：
①块体类—薄膜、布料、金属块、纸片、凝胶等
送样量：
（1）与细胞的作用方式为直接接触的话，至少1个/种细胞/时间点；
（2）样本处理方式为浸提的话，可参考国标ISO 10993-12 2007中的浸提方式浸提，根据浸提方式按量和检测时间点提供；
制样要求：若是需要把细胞接种到材料上的话，金属块、凝胶类样本须制备成统一大小的圆形/方形，建议制备直径为10-15 mm圆形。布料、纸片类样本可代为裁剪，默认制备直径为15 mm。
②液体类
送样量：根据测试时样本浓度和检测时间点而定，按照单次检测需要的3-5倍的量寄送；若采用稀释后样本测试，则须告知稀释倍数及工作液浓度；若溶剂为有机溶剂（如DMSO，醇类，酚类等），最高工作液浓度中，溶剂的占比低于0.5%；。
③粉末类
送样量：根据测试时样本浓度和检测时间点而定，按照单次检测需要的3-5倍的量寄送；
（1）可溶性粉末：注明溶剂的种类（如无水乙醇，异丙醇，DMSO，培养基，PBS或者生盐水等），当样品对溶剂有特殊需求时，请在送样时附加所需溶剂；
（2）不可溶粉末：注明样本性质，灭菌方式，及分散为均匀悬浮液所需必要步骤
5、需要提供清楚激发/发射波长，拍摄倍数等要求，
6、染色剂，标明染料名称和拍摄条件（激发/发射波长)
7、细胞类样品直接拍摄，需要封片后常温避光邮寄。
8、固体类直接拍摄样品建议长宽不超过20mm，厚度不超过10mm，重量不超过10g，一定标出测试面。
荧光显微镜（FM）在使用过程中可能会遇到多种问题，以下是一些常见的问题及其可能的解决方案：
1.荧光异常：荧光显微镜使用荧光染料或标记的样本进行观察，若出现荧光异常可能是染料或标记物的问题，也可能是显微镜镜头或荧光滤镜的问题。可以尝试更换荧光染料或标记物，或者更换荧光滤镜或镜头进行实验。
2.成像模糊：成像模糊经常发生于长时间观察或过度曝光的情况下，此外，可能还会是样本移动导致的。可以调整曝光时间，避免超过最大建议曝光时间，同时稳定样本，避免样本移动，使用样本固定装置。
3.自动对焦失效：自动对焦失效可能会造成成像模糊或者无法成像的问题。若自动对焦失效，可能是镜头转动不良或是样本的高度不一致导致。可以调整镜头，确保其能够自由转动，或者调整样本的高度，尝试多种不同高度的样本，观察是否能自动对焦。
4.其他问题：除了上述故障之外，荧光显微镜还可能遇到其他问题，例如成像偏移、白平衡不良、成像亮度不足、通道冲突等。可以尝试调整成像位置，确保成像中心位置正确，调整白平衡参数，确保成像色彩正常，调整光源亮度，或者调整荧光通道参数。
