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免疫组库就是指机体内T淋巴细胞和B淋巴细胞多样性的总和,可以全面的反映机体免疫系统在特定时间段内应对外界刺激应答的能力,可以用于表征机体免疫系统的健康状况。T细胞和B细胞的多样性主要体现在表面受体的多样性,即TCR和BCR的多样性,而TCR和BCR的多样性归根结底还是来源于胚系V、D、J基因的重组和重排。10X Genomics 单细胞平台检查免疫组库的多样性,就是通过检测受体上互补决定区CDR3区域的多样性来完成。
应用方向:
1、肿瘤免疫 2、感染性疾病 3、抗体疫苗研究 4、自生免疫疾病 5、损伤与炎症 6、移植与免疫重建 7、免疫系统发育
样品类型 | 送样量 | 预处理和保存 |
单细胞 | 1-2个(4μL PBS悬液) | 1) 将细胞分选至装有3~5μL PBS缓冲液的200μL PCR管中,细胞数目不得超过1000个。不建议另外加入其他细胞保护剂,如有特殊情况,加入其他试剂或者经过其他处理,请在样品信息单中备注。 2) 细胞分离完成后,请于10分钟内放入-80℃冰箱或者干冰保存。也可暂存于-20℃,但保存时间不得超过3小时。 3) 每个细胞样品建议送4管重复,以保证后续实验成功率。例如:需测序某一细胞样品数为5个,则建议送样细胞样品管数为20。 4) 除提供细胞样品外,还需要每批次提供一个阴性对照,即在PBS缓冲液中加入0.1~0.5 μL的1% PBS-BSA溶液(分选细胞时,细胞所处保存溶液)。 |
微量细胞 | 2≤细胞数目≤1000(4μL PBS悬液) |
1、什么是单细胞免疫组库测序?
答:单细胞免疫组库测序是一种能够同时检测单个细胞内多种免疫分子表达情况的技术。通过该技术,可以获取单个细胞表面的受体、配体以及细胞内的转录组信息,从而全面解析细胞的免疫状态和功能。
2、单细胞免疫组库测序在免疫学研究中有何应用?
答:单细胞免疫组库测序在免疫学研究中具有广泛的应用。它可以用于研究不同免疫细胞类型之间的异质性,揭示免疫细胞在不同生理和病理条件下的功能变化,以及探索免疫细胞间的相互作用和信号通路。
3、单细胞免疫组库测序与单细胞RNA测序有何不同?
答:单细胞免疫组库测序主要关注免疫分子的表达情况,包括细胞表面的受体和配体以及细胞内的转录组信息;而单细胞RNA测序则主要关注细胞内基因的表达水平。两者结合使用可以更全面地了解单个细胞的免疫特性和功能状态。
4、单细胞免疫组库测序的样本要求是什么?
答:单细胞免疫组库测序的样本通常需要是新鲜的、未经过处理的单细胞悬液。细胞应具有良好的活性、形态和数量,以减少实验过程中的技术偏差。此外,样本中的细胞应尽可能均匀分布,以确保每个细胞都有被检测到的机会。
5、单细胞免疫组库测序的实验流程是怎样的?
答:单细胞免疫组库测序的实验流程通常包括细胞样本制备、单细胞捕获、免疫分子标记、文库构建和高通量测序等步骤。通过这些步骤,可以获取单个细胞的免疫分子表达信息。
6、单细胞免疫组库测序数据如何分析?
答:单细胞免疫组库测序数据的分析涉及多个步骤,包括质量控制、单细胞的聚类、免疫分子表达的量化、差异表达分析等。需要使用专门的生物信息学工具和软件进行数据处理和分析。此外,还需要结合实验设计和背景知识进行结果解读和讨论。
7、单细胞免疫组库测序在哪些疾病研究中有应用?
答:单细胞免疫组库测序在多种疾病的研究中具有应用潜力,如癌症、自身免疫性疾病、感染性疾病等。它可以帮助研究人员了解疾病发生发展过程中免疫细胞的变化和相互作用,为疾病的诊断和治疗提供新的思路和方法。
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