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修饰蛋白组学PRM验证
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平均25个工作日
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项目介绍

PRM(平行反应监视,parallel reaction monitoring)是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术,是对传统质谱定量技术SRM/MRM的升级版,该技术能够对目标蛋白质、目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段进行绝对定量。中选生物翻译后修饰PRM靶向验证组学服务提供磷酸化、乙酰化、泛素化等翻译后修饰后PRM靶向验证,可代替Western Blot

技术特色:

1)质量精度达到ppm级,能够比SRM/MRM更好地排除背景干扰和假阳性,有效提高复杂背景下的检测限和灵敏度;

2)对子离子进行全扫描,无需选择离子对和优化碎裂能量,更容易进行方法学建立;

3)更宽的线性范围:增加至5-6个数量级

4)可替代western blot验证。



项目案例

 翻译后修饰PRM靶向验证

样品要求

样品类型

样本要求

动物组织

100mg

植物组织

500mg

细胞样品

2x10^7

 

血液等体液

1ml

微生物类(菌类)

300mg



常见问题
    1. 目标修饰位点的选择:选择合适的修饰位点进行验证是PRM实验的关键。由于修饰通常会导致蛋白质的结构和性质发生变化,因此需要选择那些对修饰敏感且具有代表性的位点。

    2. 内标准的选择与制备:对于修饰蛋白质,内标准的选择和制备可能更加复杂。通常,内标准应该是与目标修饰蛋白质结构相似但未被修饰的蛋白质,或者是具有相同修饰但修饰程度不同的蛋白质。

    3. 修饰程度的定量:修饰蛋白质通常存在多种修饰程度,如何准确定量每种修饰程度是一个挑战。这可能需要使用多个目标肽段和相应的内标准,以及精确的数据处理和分析方法。

    4. 质谱条件的优化:为了获得最佳的PRM结果,可能需要对质谱条件进行优化,包括肽段的选择、碰撞能量的调整、质谱分辨率的设定等


 
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