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蛋白(核酸)分子动力学
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项目介绍

生物大分子动力学

      通过分子动力学等方法,模拟蛋白,DNARNA等分子在不同温度,PH值,电压等各种条件下结构变化,预测不同分子间结合自由能,分析药物结合大分子后对其二级结构的影响,从而多角度阐述生物结构变化所导致的变化状况,阐明人体生物致病等生物性状机理。

     在分子动力学模拟中,分子的运动是通过数值求解牛顿运动方程来得到的。通常,模拟开始时,需要设定分子的初始位置和速度,这些值可以根据特定的分布(如波尔兹曼分布)随机生成。随后,通过模拟分子之间的相互作用(这些相互作用通常由力场来描述),可以计算出分子在一段时间内的运动轨迹。

     分子动力学模拟的结果可以用于计算体系的构型积分,进而得到体系的热力学量和其他宏观性质。这使得分子动力学成为研究复杂体系热力学性质的一种有效方法。此外,分子动力学模拟还可以用于研究体系的动态演化过程,如化学反应、相变等,从而揭示这些过程的微观机理。

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项目案例

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样品要求

需要撰写需求文件,说明分子对接需求,并提前与工程师沟通联系。

常见问题

    一、如果计算结果与预期不符合怎么办?

    1.科研计算服务是一个探索的过程,其中存在不确定性。服务方对理论计算得到的数据负责, 但不保证理论数据能够与预期结果完全一致。如果需要可以对模型进行适当调整,调整过程中若增加计算或者大规模的重新计算,需增加计算费用,价格另行协商。

    2.模拟计算存在不确定性,我们对计算过程的正确性负责。计算开始之后会消耗软件,机时以及人力成本,所以不支持退款,敬请谅解

     

    二、模拟计算项目服务范围?

    1.计算完成之后提供所需的计算方法,计算结果数据和图文,以及关于计算结果中疑问的解答;

    2.文章回复意见中模拟计算问题进行适当的解答,若返稿后需要增加计算,需另行收费。

     

    三、关于模拟计算下单流程是怎么样的呢?

    1.如果是确定计算需求,可以直接在测试狗官网选择相应的项目进行下单,提交订单时需填写具体的计算内容,预期结构,分子结构及相关的参考文献。如果网站上没有对应的项目请选择【私人定制】并在需求中写明具体计算内容;

    2.如果不能确定计算内容,可以直接联系工作人员进行需求沟通。

     


 
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