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LC-MS/MS质谱以高效液相色谱作为分离系统，质谱为检测系统。将蛋白酶切消化为肽段混合物，之后这些肽段先经高效液相色谱分离，然后进入质谱部分。经离子源离子化后，再经质量分析器将离子碎片按质量数分开，经检测器得到对应质谱图，通过数据库搜索达到蛋白质鉴定的目的。
蛋白质组学分析：LC-MS/MS是蛋白质组学中的常用技术，它通过高效液相色谱法将蛋白质样品分离纯化，然后利用质谱技术对分离出的蛋白质进行定性、定量和结构分析。通过一级质谱的分子离子峰和二级质谱的碎片离子峰信息，可以准确分析出蛋白质的种类、含量以及结构等信息。
蛋白质测序：在蛋白质测序方面，LC-MS/MS通过酶解将蛋白质转化为多肽混合物，然后利用高效液相色谱分离和串联质谱碎裂多肽片段，通过对每个片段进行质谱分析，获取到大量的MS/MS谱图，这些谱图可用于在蛋白质数据库中搜索匹配的肽序列，从而实现对蛋白质的鉴定。
蛋白质翻译后修饰位点分析：LC-MS/MS技术还可以用于分析蛋白质翻译后的修饰位点，这对于理解蛋白质的功能和调控机制具有重要意义。
定量蛋白质组学：在定量蛋白质组学方面，LC-MS/MS技术依据质谱峰的强度信息，实现对蛋白质的定量检测，有助于研究蛋白质在生物体内的表达水平和变化。
关于样品：可以提供蛋白冻干粉，蛋白溶液或蛋白质胶条；至少需要20ug的蛋白质，纯度>90% ；含盐量：挥发性无机盐<20mM，不挥发性无机盐<5mM；蛋白溶液避免SDS等变性剂，表面活性剂，不含tris缓冲体系。
样品运输：请使用足量的干冰运输，并尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。
1、LS-MSMS质谱鉴定蛋白性价比如何？
和传统技术相比，LS-MSMS鉴定蛋白具有天然优势，通量高（一次上千种蛋白的鉴定量），鉴定直接高效（针对肽段直接鉴定），相比其他方式性价比高。
