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方法简介
质谱法能对侧链基团翻译后加工或化学修饰进行定位，且弥补了传统的Edman降解法不适用于N端封闭的缺陷。且蛋白质的C末端分析并不能采取类似N端的化学分析，现阶段是采取质谱法对蛋白质样品的C末端序列进行分析。质谱法N/C端测序可以用于确认重组蛋白是否得到完整表达，以及重组蛋白N端和C端序列是否发生修饰。我们首先分析靶蛋白的氨基酸序列信息，选择特定的蛋白酶对靶蛋白进行酶切，得到合适长度的蛋白质N端和C端肽段，然后进行质谱分析，确认靶蛋白的N端和C端序列信息。
关于样品：可以提供蛋白冻干粉或蛋白质溶液；至少需要20ug的蛋白质，纯度>90% ；含盐量：挥发性无机盐<20mM，不挥发性无机盐<5mM；蛋白溶液避免SDS等变性剂，表面活性剂，不含tris缓冲体系。
样品运输：请使用足量的干冰运输，并尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。
质谱法N/C端测序是一种重要的生物技术手段，用于确定蛋白质的N端（氨基端）和C端（羧基端）序列信息。这些信息在生物制药、生物医药以及精准医疗等领域中具有重要意义，可用于确认重组蛋白的完整表达，分析蛋白质修饰，以及进行工艺优化等。
质谱法能够对蛋白质的侧链基团翻译后加工或化学修饰进行定位，并可以测定封闭和修饰的蛋白质末端。其流程大致为首先分析靶蛋白的氨基酸序列信息，选择特定的蛋白酶对靶蛋白进行酶切，得到合适长度的蛋白质N端和C端肽段，然后进行质谱分析，确认靶蛋白的N端和C端序列信息。
此外，质谱法N/C端测序还具有高度的准确性，每个氨基酸有超过十种不同的肽段支持，每个氨基酸在质谱图里有强的离子片段峰证据，从而保证每个位点的氨基酸100%的准确性。
尽管质谱法具有诸多优点，但每种测序方法都有其局限性。因此，在实际应用中，可能需要结合多种不同的测序方法，以适应各种蛋白质测序的需求。例如，当Edman降解法无法解决N端封闭和蛋白质修饰的测序问题时，质谱法可以作为有效的补充手段。
