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项目介绍
应用场景
比较不同物种间同源蛋白发生特定修饰的位点的交叠情况。
分析方法
使用 BLAST 方法对给定物种的蛋白序列进行同源比对分析，通过适当的过滤条件，筛选出直系同源蛋白。然后用 MUSCLE 软件对找到的同源蛋白进行多序列比对。根据多序列比对结果，统计相互比较的两个物种在相同比对位置同时发生特定修饰的位点数，并以韦恩图展示。
项目案例
图表展示
注：不同物种间同源蛋白鉴定到修饰位点的比较分析Venn图。交叠部分为同源蛋白相同比对位置发生相同修饰的位点个数。
样品要求
需要撰写需求文件，提交蛋白序列或蛋白序列号，并提前与工程师沟通联系。
常见问题
参考文献
Altschul, S. F. . (2012). Basic local alignment search tool (blast). Journal of Molecular Biology, 215(3), 403-410.
Edgar, R. C. . (0). Muscle: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nuclc Acids Research(5), 1792-1797.
