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GC-MS非靶代谢
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产品定义
利用气相色谱-质谱联用（GC-MS）技术，采用衍生化方法对样本中的代谢物进行非靶向代谢组学检测，再结合本地自建代谢物数据库和公共数据库进行信息匹配实现代谢物鉴定，通过衍生化技术可增强对强极性物质的检出,如氨基酸类化合物、有机酸、有机醇、有机胺类等化合物。
技术路线
技术优势
1.高性能仪器：采用LECO Pegasus BT仪器检测；
2. 高定性准确度：自建1000+常见物质标品数据库+公共数据库，结合保留时间指数、碎片离子信息进行定性；
3.专业处理软件：采用高性能的ChromaTOF数据处理软件解析数据；
4. 技术成熟稳定、分辨率高、选择性好。
推荐组合产品
1. GC非靶向代谢组+非靶代组plus：全面研究各类型小分子代谢物在样本中的变化情况和内在关系
2. GC非靶向代谢组+蛋白/转录组：上游（蛋白/转录）+下游（代谢）表明因果
推荐应用领域
1. 生命科学
2. 疾病预防控制
3. 环境毒理研究
4. 食品安全/食品风味
5. 石油化工
6. 药物研究
数据分析
服务标准 | 分析类型 | 分析内容 | 拟解决问题 |
标准分析 | 质控 | TIC等多项QC分析 | 获得高质量数据 |
轮廓分析 | Superclass分类 | 获得代谢物的分类信息 | |
差异分析 | 单变量统计分析（火山图等） | 反映每个变量的组间差异 | |
多维统计分析（PCA、PLS-DA、OPLS-DA等） | 评估组间差异，找到导致组间差异的影响变量 | ||
功能分析 | 层次聚类分析 | 获得代谢物的表达模式信息 | |
相关性分析 | 衡量两个变量的相关程度 | ||
KEGG分析 | 进一步了解相关代谢通路和生物学功能 | ||
高级分析 | 生信分析 | WGCNA | 获得与表型强关联的核心代谢物 |
回归分析 | 建立重要代谢物和其他指标的关联 | ||
趋势聚类分析 | 探讨代谢物的含量趋势模式 |
部分数据分析结果展示
| 组内样本数量 | 样品类型 | 送样量 | 预处理和保存 |
| 临床样本≥30； 实验动物≥10； 植物≥8； 软体动物≥8； 微生物≥6； 细胞≥6 | 动物组织 | ≥200 mg | PBS 洗涤去除残留血液和污染物，冲洗干净。用组织剪或手术刀将组织剪切成 1cm3 左右的小块，样品称重，等量分装。液氮速冻， -80°C 保存，干冰运输。 |
| 血清 | ≥300 μL | 收集好的全血室温静置 30-60 min，或者 4°C 放置 2h，3000 g 离心 10 min，取上清，液氮速冻，-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 血浆 | ≥300 μL | 收集好的全血加入抗凝剂（推荐采用肝素抗凝剂，不建议采用柠檬酸或者 EDTA），室温静止 30 分钟，1300g-2000g 离心 10min，取上清，液氮速冻，-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 尿液 | ≥300 μL | 5000×g 4°C 离心 30-60min，取上清， -80°C 保存，干冰运输。 | |
| 粪便 | ≥200 mg | 新鲜粪便样本收集好后，立即用液氮速冻处理15 min，保存至-80℃冰箱 | |
| 肠道内容物 | ≥200 mg | 新鲜肠道内容物样本收集好后，立即用液氮速冻处理15 min，保存至-80℃冰箱 | |
| 乳汁 | ≥300 μL | 收集母乳，-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 唾液 | ≥1 mL | 1000g-2000g 4°C 离心 10min，（或使用 0.22μm 滤膜过滤），取上清，-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 淋巴液、脑脊液、羊水、胆汁等体液 | ≥300 μL | 1000g-2000g 4°C 离心 10min，（或使用 0.22μm 滤膜过滤），取上清，-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 穿刺样品 | ≥500 mg | 收集样品，采用 PBS 洗涤去除样品表面泥土或污染物（务必清洗干净！！），样品称重，等量分装，液氮速冻，-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 植物组织 | ≥500 mg | 收集样品，采用 PBS 洗涤去除样品表面泥土或污染物（务必清洗干净！！），样品称重，等量分装，液氮速冻，-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 植物体液 | ≥300 μL | 5000×g 4°C 离心 30-60min，取上清，-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 土壤 | ≥10 g | 收集样品，-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 水 | ≥50 mL | 收集样品，过滤(0.22μm滤膜)，-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 软体动物组织 | ≥500 mg | 收集样品，采用 PBS 洗涤去除样品表面泥土或污染物（务必清洗干净！！），样品称重，等量分装，液氮速冻，-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 低等细菌细胞 | ≥10 ^ 9 | 离心收集等量菌体（保证每份收集的菌体细胞数量一致！！），采用 PBS 清洗三次，每次清洗后 5000g 4°C离心 5 分钟，完全弃去上清，收集在 1.5ml 离心管中。液氮速冻，-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 菌体（真菌类） | ≥500 mg | 收集菌体（保证每份收集的菌体数量或者重量一致！！），采用 PBS 清洗三次，每次清洗后 5000g 4°C 离心 5 分钟，完全弃去上清，收集在 1.5ml 离心管中。液氮速冻，-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 悬浮培养细胞 | ≥10^7 | 离心收集悬浮细胞（保证每份收集的细胞数量一致！！），采用 PBS 清洗两遍，然后采用生理盐水（0.9%氯化钠溶液）洗一遍， 每次清洗后采用小于 1000g 离心力 4°C 低速离心 3 分钟，完全弃去上清（上述整个过程需尽量迅速操作），收集在 1.5ml 离心管中。液氮速冻后-80°C 保存，干冰运输。 | |
| 贴壁培养细胞 | ≥10^7 | 收集培养好的贴壁细胞（保证每份收集的细胞数量一致！！）去除干净培养基，采用预冷的 PBS 洗两遍，然后再次加入预冷的PBS，把培养容器中的所有细胞都收集下来（一定要刮取干净！！），收集在 1.5 mL 离心管中， 4°C 低速离心，完全弃去上清（上述整个过程需尽量迅速操作）。细胞沉淀在液氮速冻后-80°C保存，干冰运输。 | |
| 细胞培养上清 | ≥10 mL | 1000 g，4°C离心3 分钟，取上清，-80°C 保存，干冰运输。 |
对照组设置：确保实验设计包含适当的对照组，以区分实验处理引起的代谢变化和背景变化。
生物学重复：进行足够的生物学重复以提高结果的统计效力。
样本收集与处理：遵循标准化的样本收集、存储和处理流程，以减少样本间的变异性。
代谢物提取：选择合适的提取方法以确保最大程度地提取出代谢物，同时避免代谢物的降解或修饰。
内标使用：考虑添加内标物来校正实验过程中的技术变异。
仪器校准：定期进行仪器校准和维护，确保仪器性能稳定。
方法优化：根据代谢物的性质调整GC-MS方法，如色谱柱选择、升温程序、电离方式等。
数据采集：确保在仪器的线性范围内采集数据，避免信号饱和或检测限以下的数据。
数据预处理：进行基线校正、噪声去除、峰对齐和归一化等预处理步骤。
代谢物鉴定：结合数据库搜索、保留时间、质谱碎片等信息进行代谢物鉴定。
统计分析：使用适当的统计方法进行数据分析，如主成分分析（PCA）、偏最小二乘判别分析（PLS-DA）等。
代谢通路分析：利用代谢通路数据库和软件进行代谢通路分析，以解释代谢物变化背后的生物学意义。
结果解释：结合实验目的和背景知识，合理解释代谢组学数据。
后续验证：对关键代谢物进行后续验证实验，如使用其他分析技术（如LC-MS）进行确认。
质量控制：实施严格的质量控制措施，如使用质控样本、监控仪器性能等。
报告撰写：编写详细的实验报告，包括实验设计、方法、结果和讨论等部分。
