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修饰蛋白组学PRM验证
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PRM（平行反应监视，parallel reaction monitoring）是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术，是对传统质谱定量技术SRM/MRM的升级版，该技术能够对目标蛋白质、目标肽段（如发生翻译后修饰的肽段）进行选择性检测，从而实现对目标蛋白质/肽段进行绝对定量。中选生物翻译后修饰PRM靶向验证组学服务提供磷酸化、乙酰化、泛素化等翻译后修饰后PRM靶向验证，可代替Western Blot。
技术特色：
（1）质量精度达到ppm级，能够比SRM/MRM更好地排除背景干扰和假阳性，有效提高复杂背景下的检测限和灵敏度；
（2）对子离子进行全扫描，无需选择离子对和优化碎裂能量，更容易进行方法学建立；
（3）更宽的线性范围：增加至5-6个数量级；
（4）可替代western blot验证。
样品类型 | 样本要求 |
动物组织 | ≥100mg |
植物组织 | ≥500mg |
细胞样品 | ≥2x10^7
|
血液等体液 | ≥1ml |
微生物类（菌类） | ≥300mg |
目标修饰位点的选择：选择合适的修饰位点进行验证是PRM实验的关键。由于修饰通常会导致蛋白质的结构和性质发生变化，因此需要选择那些对修饰敏感且具有代表性的位点。
内标准的选择与制备：对于修饰蛋白质，内标准的选择和制备可能更加复杂。通常，内标准应该是与目标修饰蛋白质结构相似但未被修饰的蛋白质，或者是具有相同修饰但修饰程度不同的蛋白质。
修饰程度的定量：修饰蛋白质通常存在多种修饰程度，如何准确定量每种修饰程度是一个挑战。这可能需要使用多个目标肽段和相应的内标准，以及精确的数据处理和分析方法。
质谱条件的优化：为了获得最佳的PRM结果，可能需要对质谱条件进行优化，包括肽段的选择、碰撞能量的调整、质谱分辨率的设定等
