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蛋白（核酸）分子动力学
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生物大分子动力学
通过分子动力学等方法，模拟蛋白,DNA及RNA等分子在不同温度，PH值，电压等各种条件下结构变化，预测不同分子间结合自由能，分析药物结合大分子后对其二级结构的影响，从而多角度阐述生物结构变化所导致的变化状况，阐明人体生物致病等生物性状机理。
在分子动力学模拟中，分子的运动是通过数值求解牛顿运动方程来得到的。通常，模拟开始时，需要设定分子的初始位置和速度，这些值可以根据特定的分布（如波尔兹曼分布）随机生成。随后，通过模拟分子之间的相互作用（这些相互作用通常由力场来描述），可以计算出分子在一段时间内的运动轨迹。
分子动力学模拟的结果可以用于计算体系的构型积分，进而得到体系的热力学量和其他宏观性质。这使得分子动力学成为研究复杂体系热力学性质的一种有效方法。此外，分子动力学模拟还可以用于研究体系的动态演化过程，如化学反应、相变等，从而揭示这些过程的微观机理。
需要撰写需求文件，说明分子对接需求，并提前与工程师沟通联系。
一、如果计算结果与预期不符合怎么办？
1.科研计算服务是一个探索的过程，其中存在不确定性。服务方对理论计算得到的数据负责， 但不保证理论数据能够与预期结果完全一致。如果需要可以对模型进行适当调整，调整过程中若增加计算或者大规模的重新计算，需增加计算费用，价格另行协商。
2.模拟计算存在不确定性，我们对计算过程的正确性负责。计算开始之后会消耗软件，机时以及人力成本，所以不支持退款，敬请谅解
二、模拟计算项目服务范围？
1.计算完成之后提供所需的计算方法，计算结果数据和图文，以及关于计算结果中疑问的解答；
2.文章回复意见中模拟计算问题进行适当的解答，若返稿后需要增加计算，需另行收费。
三、关于模拟计算下单流程是怎么样的呢？
1.如果是确定计算需求，可以直接在测试狗官网选择相应的项目进行下单，提交订单时需填写具体的计算内容，预期结构，分子结构及相关的参考文献。如果网站上没有对应的项目请选择【私人定制】并在需求中写明具体计算内容；
2.如果不能确定计算内容，可以直接联系工作人员进行需求沟通。
